W głębi dżungli Południowego Pacyfiku eksplozja nuklearna powołuje do życia niezwykłą istotę. Przez dziesiątki lat pozostawała w ukryciu, teraz pokaże się światu w całej swej okazałości. Jest najsłynniejszym potworem w historii kina, ma stopę wielkości autobusu, ogon długości ratuszowej wieży i siłę, której nikt nie dorówna.

Lata 50-te. Wojsko przeprowadza próbę nuklearną na atolu Mururoa. W wyniku eksplozji napromieniowane zostają jaja licznie tam występujących gadów z gatunku waranów... Czterdzieści lat później. Monstrualna istota niewiadomego pochodzenia atakuje japoński statek na morzach południowych. Z katastrofy uchodzi z życiem jeden z rybaków... Młody amerykański naukowiec, dr Niko Tatopoulos prowadzi badania w rejonie Czernobyla. Ich celem jest wykazanie wpływu promieniowania na mutacje w organizmach występujących tam zwierząt. Nieoczekiwanie Niko zostaje odwołany i przewieziony transportem wojskowym na miejsce katastrofy japońskiego statku. Wraz z parą paleontologów, dr Elsie Chapman i dr Mendelem Cravenem, ma wyjaśnić jej przyczyny. Na lądzie odkryte zostają gigantyczne ślady tajemniczej istoty, w burcie statku zaś olbrzymia wyrwa ze śladami pazurów... Na miejscu zdarzeń przebywa także enigmatyczny Philippe Roache podający się za francuskiego agenta ubezpieczeń i żywo zainteresowany odkryciem sprawcy tragedii. Zdaniem dr. Tatopoulosa wszystko wskazuje na obecność ogromnego, nieznanego dotąd gada. Uratowany rozbitek z japońskiego statku nazywa go "Gojira", imieniem legendarnego węża morskiego, które wkrótce przybiera angielską formę "Godzilla"... Nowy Jork. U wybrzeży amerykańskiej metropolii giną łowiące tam statki rybackie. Wkrótce Godzilla atakuje miasto siejąc panikę na jego ulicach i przerywając wiec wyborczy szykującego się do reelekcji burmistrza Eberta. Akcja wojska niewiele daje, potwór ukrywa się tylko, gotowy w każdej chwili do ponownego ataku... Wybijająca się młoda dziennikarka Audrey Timmonds widzi w Godzilli szansę na zdobycie materiału, który zapewni jej błyskawiczną karierę w mediach. Odnajduje przybyłego do Nowego Jorku dr. Tatopoulosa, który jest jej byłym chłopakiem. Wykrada mu kasetę z nagraniem słów japońskiego rybaka, którą jednak jej szef-megaloman, Charles Caiman, prezentuje na antenie jako zdobytą przez siebie. Tymczasem dr Niko Tatopoulos odkrywa, że Godzilla zniosła ponad dwieście jaj w zrujnowanym gmachu Madison Square Garden. Katastrofie zapobiec mogą jedynie on sam, przybyły do miasta Philippe Roache, który okazuje się agentem francuskich służb specjalnych oraz wytrwale tropiący Godzillę Audrey Timmonds i współpracujący z nią kamerzysta Victor "Animal" Palotti...

Lata 90. XX w. Nieznane monstrum atakuje na Pacyfiku japoński statek. Amerykański naukowiec, doktor Niko Tatopoulos (Matthew Broderick), rozpoczyna badanie tego wypadku. Dołącza do niego tajemniczy Francuz, Philippe Roaché (Jean Reno). Tymczasem potwór nazywany Godzillą pojawia się w Nowym Jorku i atakuje miasto. Przybyły na miejsce Niko odkrywa kilkaset jaj gada. Z pomocą Philippe'a próbuje zapobiec katastrofie.