Wiktimowie (obca rasa) atakuje coraz zacieklej Ziemię. Jedyną skuteczną bronią przeciw wrogom jest pięć mechów o ludzkich twarzach, za ich sterami zasiadają piloci posiadający moc zwaną "EX". W tym samym czasie do akademii przybywa chłopiec imieniem Zero, który bardzo chce zostać pilotem...