Scooby-Doo wraz z przyjaciółmi wybiera się w odwiedziny do młodszej siostry Velmy - Madelyn, która studiuje w Magicznej Akademii Whirlena Merlina. Tam jednak natrafiają na kłopoty - okazuje się, że w okolicy pojawił się mitologiczny zwierz pół-smok, pół lew znany bardziej jako gryfon, pustoszący ziemię wokół uczelni. Tajemnicza spółka po raz kolejny postanawia rozwiązać zagadkę.

Gdy zaciszna szkoła dla magików zostaje zaatakowana przez latającego potwora z jednej strony, a z drugiej przez tajemnicze złowróżbne siły, tylko jeden okrzyk przychodzi na myśl: Abrakadabra-Doo! Czas na nową niesamowitą zagadkę, którą rozwiązać mogą jedynie Scooby-Doo i Brygada Detektywów! Z tymi detektywami zabawa jest zawsze magiczna!