Po tym jak zostaje odkryta tajemnica dziewiątego chevronu, przez wrota zostaje wysłana drużyna, która trafia na bezzałogowy statek zwany "Destiny", wysłany przez Pradawnych w podróż po wszechświecie, z misją rozsiewania sieci gwiezdnych wrót w różnych galaktykach. Był to ich wielki eksperyment, który jednak nie został skończony, gdyż Ci go porzucili i zaczęli prace nad ascendencją.

Misja, która zaczyna się jako zwykły rekonesans, przeistacza się w nigdy niekończącą się misję, gdyż jak się okazuje, statek nie może powrócić na Ziemię.

Tajemnica "Dziewiątego Chevronu" została odkryta, doprowadzając ekipę badaczy do ogromnego statku o nazwie "Przeznaczenie", zbudowanego przed milionami lat przez Pradawnych. Był to wielki projekt, którego zadaniem było rozsiać Gwiezdne Wrota w odległych galaktykach. Nie został on jednak ukończony, ponieważ został porzucony na rzecz ascendencji. Zespół pod dowództwem pułkownika Everetta Younga (Louis Ferreira) szybko dowiaduje się, że statek nie może wrócić na Ziemię. Uwięzieni na jego pokładzie muszą kontynuować pracę Pradawnych, wyruszając w nieznane zakątki kosmosu oraz odkrywając nowe rasy, nową technologię, ale i nowych wrogów.

Podczas ataku na tajną bazę, grupa ludzi, w tym żołnierze, naukowcy i cywile muszą uciekać przez gwiezdne wrota. Pozostali przy życiu pojawili się na statku "Przeznaczenie", z którego nie ma wyjścia, leci on w nieznanym kierunku, a uwięzieni na nim ludzie nie mają możliwości powrotu na Ziemię. Grupa uchodźców musi jak najszybciej poznać tajemniczy statek, aby zapewnić sobie podstawy do przetrwania, takie jak jedzenie, woda i powietrze. Niebezpieczeństwo, przygoda i nadzieja wyłoni z załogi bohaterów i łajdaków.