Yoshimori Sumimura to 14-letni uczeń gimnazjum, który jest eksterminatorem potworów określanym jako Kekkaishi. Wraz ze swoją koleżanką z dzieciństwa, Tokine Yumikurą, rywalizuje o zostanie spadkobiercą klanu Sumimura. Aby tego dokonać Yoshimori chroni ludzi przed potworami, stając się przy tym coraz silniejszym wojownikiem.