Kazamatsuri, nowoczesne i dobrze rozwinięte miasto, zaprojektowane w sposób taki, by mogło funkcjonować zgodnie z prawami natury oraz kulturą Japonii. Jest to także miejsce zamieszkania Kotarou Tennoujiego, dumnego i trochę wścibskiego ucznia szkoły średniej, który cały swój czas spędza na nic nierobieniu. Posiada on nadnaturalną zdolność nadpisywania każdej części ciała, czego skutkiem ubocznym jest wzrost siły i wytrzymałości fizycznej. Pewnego razu wpada na pomysł, by wznowić działalność klubu badaczy zjawisk paranormalnych, w tym celu rekrutuje do niego swoich znajomych - Kotori Kanbe - przyjaciółkę z dzieciństwa, Lucię Konohanę - przewodniczącą jego klasy oraz nowo poznane - Chihayę Ootori, Akane Senri i Shizuru Nakatsu. Przez przypadek odkrywają oni pewną tajemnicę związaną z miastem Kazamatsuri, czego następstwem jest niespodziewane zamknięcie ich klubu...