Podziemne królestwo Seatopii wysyła wielkiego żuka Megalona wraz z Giganem by zniszczyli mieszkańców powierzchni. Pragnąc ich powstrzymać pewnien niezależnie myślący robot przekonuje Godzillę do walki.
Po ostatnich walkach Godzilli wiele zabytkowych przybrzeżnych posągów zostało zniszczonych. Królestwo Seatopi postanawia wysłać swoje dwa najpotężniejsze potwory, Megalona i Gajdana. Na pomoc Godzilli przybywa robot stworzony przez ziemian. Rozpoczyna się piekielna walka.
Eksperymenty z bronią nuklearną prowadzone przez ludzi zagrażają podwodnemu królestwu Seatopia. Jego mieszkańcy postanawiają zniszczyć życie na ziemi. Ich obrońca - monstrualny owad Megalon oraz wezwany z kosmosu Gigan bezlitośnie atakują naszą cywilizację. Cyborg, który staje po stronie ludzi, nie jest w stanie sam zwyciężyć najeźdźców. Dopiero gdy na pomoc przybywa niezawodna Godzilla fantastyczna walka kończy się pokonaniem Megalona i Gigana.