Trzecia część fabularnej serii "Piekielna głębia". Dr Emma Collins bada wpływ klimatu na rekiny, które co roku przybywają na wyspę Little Happy, by rodzić młode. Gdy zespół pseudonaukowców, pod kierownictwem byłego chłopaka Emmy, przybywa na wyspę w poszukiwaniu trzech, zmutowanych genetycznie rekinów, rozpoczyna się niebezpieczna gra na oceanie.

Bohaterką filmu Deep Blue Sea 3 jest Emma Collins, wybitna biolog morska, która wraz ze swoim zespołem zakłada laboratorium na oceanie w zatopionym miasteczkiem, aby obserwować gody żarłaczy białych. Niestety ulepszone żarłacze tępogłowe, które uciekły w poprzedniej części serii mają swoje własne plany, chcą skrzyżować się ze wspomnianymi, szybszymi i silniejszymi żarłaczami białymi. Sponsor misji, Richard Lowell uważa tępogłowe za klucz do poprawy inteligencji i zamierza sprzedać badania. Nasi bohaterowie będą musieli walczyć o przetrwanie, uwięzieni w laboratorium na oceanie pełnym rekinów.

Little Happy to sztuczna wysepka w Kanale Mozambickim i ulubione miejsce lęgowe wielu morskich stworzeń, w tym żarłaczy białych. Spokoju tego rezerwatu strzeże córka jego zmarłego twórcy, Emma Collins, wraz z ekipą aktywistów. Idylla zostaje gwałtownie przerwana, gdy przyjeżdża były chłopak Emmy polujący na trzy żarłacze tępogłowe oskarżone o rozszarpanie sześciu ludzi. Ich matka Bella jest genetycznie zmodyfikowaną, inteligentną bestią.