IMHO:
1. Kto ranił chłopca? Skąd te otarcia, szramy na plecach itp?
Skoro duchy mogą ingerować w świat fizyczny (zmiana temperatury, otwieranie szuflad, zamykanie drzwi) to mogą też podrapać. Ewentualnie w panice też mógł się drapać i ranić.

2. Jakim cudem Malcolm był w stanie usłyszeć ducha na kasecie? Wiem, że dał dźwięk na fulla, ale czy usłyszenie ducha było możliwe? Czy był w stanie usłyszeć go dlatego, że był duchem?
Z jednej strony jest to strasznie naciągane (można nagrać ducha, ale usłyszy go tylko inny duch), ale z drugiej jak wiemy duchy "widzą tylko to co chcą widzieć", więc pewnie i słyszą też - czyli gdy doktor uwierzył chłopcu to zaczął odnajdywać dowody.

3. Dziewczyna, która była truta przez matkę - czy wiedziała o tym za życia?
Obie wersje są możliwe:
TAK: nagrała matkę (macochę?) specjalnie, żeby udowodnić, że jest truta, ale nie miała odwagi lub była zbyt osłabiona żeby dotrzeć z tym do świadomości ojca.
NIE: nagrała to przypadkiem, a nie przyznała się bo np. zabroniono jej zabaw z kamerą, dlatego trzymała kasetę schowaną.