Uczęszczał do Bonita Vista Junior High (Bonita Vista Middle) w Chula Vista (Kalifornia, USA).
Jest synem Vivienne Bellisario.
Jest bratem aktora Chada W. Murray'a.
Sean ma czwórkę przyrodniego rodzeństwa - Troian Avery Bellisario (w serialu "Agenci NCIS" gra siostrę bohatera Seana), Michael Bellisario, Julie B. Watson i David Bellisario.
Całe rodzeństwo pracuje przy tworzeniu serialu "Agenci NCIS".
Ojczymem Seana jest Donald P. Bellisario - pomysłodawca serialu "Agenci NCIS", w którym Sean gra jedną z głównych ról.