Bohaterami gry "Instinct" jest trójka komandosów, która ocalała po katastrofie śmigłowca w Północnej Korei. Ich zadaniem jest infiltracja kompleksu badawczego, który został opanowany przez ugrupowanie terrorystyczne, które ma zamiar użyć niebezpiecznego wirusa o nazwie Instinct. Podczas misji dochodzi jednak do wypadku i jeden z członków personelu naukowego zostaje zarażony wirusem....