"Resonance of Fate" przedstawia przyszłość, w której ziemia przestaje być miejscem na którym można żyć. Jedyną szansą na przetrwanie jest wieża podobna do biblijnej wieży Babel - zbudowana jako eksperyment mający poprawić jakość życia. Obecnie stanowi jedyne miejsce gdzie ludzie mogą bez problemu funkcjonować. Wcielając się w jednego z bohaterów Vashyron, Zephyr czy Leanne wypełaniaj zadania i wyrusz w podróż, która odkryje przed tobą ciemne sekrety świata.