Kazuda Xiono, młody pilot Ruchu Oporu, ma za zadanie wykonać ściśle tajną misję, polegającą na zbadaniu Najwyższego Porządku, rosnącego zagrożenia w galaktyce.

Wojny Klonów obejmują kolejne planety galaktyki. Wielka Armia Republiki, prowadzona przez rycerzy Jedi, stawia czoło siłom zbrojnym separatystów.