W 2024 roku ruiny Japonii zamieszkują surrealistyczne potwory, a ocalali ludzie walczą o przetrwanie. Kiruko postanawia spełnić ostatnie życzenie tajemniczej umierającej kobiety, by zabrać jej syna Maru do miejsca zwanego Niebem.
Połączone siły Imperium Mocy Tsukasy oraz Królestwa Nauki chcą dopłynąć na drugi koniec świata, by poznać tajemnice jasnego świtała, które doprowadziło ludzkość do zagłady.
Na skutek tajemniczego rozbłysku światła cała ludzkość zostaje zamieniona w kamień. Po trwającej kilka tysięcy lat petryfikacji Taiju oraz jego genialny przyjaciel Senku wybudzają się i przystępują do odbudowy zniszczonej cywilizacji.