"Rekrut: FBI" przedstawia losy Simone Clark, która po latach pracy jako szkolny doradca zawodowy postanowiła spełnić swoje marzenie o pracy w szeregach FBI. Najstarsza debiutantka w historii biura poza swoimi codziennymi obowiązkami musi zmierzyć się z wątpliwą wiarą współpracowników w jej umiejętności. Burzliwe życie osobiste głównej bohaterki tworzy barwne tło do najciekawszych zagadek kryminalnych Los Angeles.
Grupa rekrutów przechodzi szkolenie w bazie FBI. Jeden z nich jest odpowiedzialny za największy zamach terrorystyczny na terenie Stanów Zjednoczonych po 11 września.
Podrzędny urzędnik FBI Walter Weed nieświadomie zostaje wzięty na celownik zamachowców, a dowódca gangu przestępczego Hal Leuco wyznacza za niego nagrodę.