Wojownicze żółwie ninja muszą wspiąć się na wyżyny swoich umiejętności, gdy Ziemię atakują bezlitosne i niosące chaos istoty z innego świata.

Czterej wojownicy muszą się zmierzyć z cieszącym się bardzo złą sławą Krangiem.

Wojownicze Żółwie Ninja powracają po latach nieobecności na dużym ekranie. Po pokonaniu starego wroga, Shreddera, rodzina żółwi zaczyna się rozpadać. Niepokój Splintera wzmagają dziwne wydarzenia do jakich dochodzi w Nowym Jorku. Przemysłowiec Max Winters po postrzeleniu staje się szalony. Zaczyna gromadzić armie starożytnych potworów. Kiedy uświadamia sobie, że jego plan zaczyna odnosić sukces, nie jest dłużej usatysfakcjonowany z zemsty przeciw byłemu pracodawcy. Teraz jego celem staje się dominacja nad całym światem.