16-letnia Shizuku Mizutani jest jedną z najlepszych uczennic w szkole, a jej świat kręci się wyłącznie wokół nauki. Pewnego dnia zostaje oddelegowana przez jedną z nauczycielek, by dostarczyć materiały z lekcji Haru Yoshidzie. Chłopak, znany ze swojej porywczości, już pierwszego dnia szkoły wdał się w bójkę, przez co został tymczasowo zawieszony. Boją się go zarówno uczniowie, jak i nauczyciele i nikt nie ma odwagi przekonać go do powrotu. Ku zaskoczeniu wszystkich, wizyta Shizuku sprawia, że Haru zmienia zdanie i postanawia wrócić do szkoły. Dziewczynę zaś, ku jej niezadowoleniu, uznaje za swoją nową przyjaciółkę i od tej pory nie odstępuje jej na krok.
Zbliżają się święta Bożego Narodzenia, a wyjątkowo podekscytowana tym faktem Haruhi Suzumiya postanawia z tej okazji zorganizować przyjęcie w którym uczestniczyć mają wszyscy członowe Brygady SOS. Wydawałoby się, że wszystkie przygotowania idą wyjątkowo spokojnie, szczególnie biorąc pod uwagę stabilny stan emocjonalny Haruhi, ale gdy następnego dnia Kyon udaje się do szkoły okazuje się, że nikt taki jak Haruhi Suzumiya nigdy nie uczęszczał z nim do jednej klasy, mało tego Brygada SOS zdaje się również nie istnieć.
Serial opowiada historię Ookami Ryouko, licealistki znanej ze swojego groźnego wyglądu i zachowania chłopczycy. Razem z koleżanką z klasy - Akai Ringo należą do Otogi High School Bank. Jest to swego rodzaju organizacja zajmująca się handlem przysługami. Uczniowie mogą przyjść tam gdy mają kłopoty i poprosić o pomoc, a w zamian będą kiedyś poproszeni by tę przysługę odwzajemnić. Ponieważ niektóre z zadań banku bywają niebezpieczne postanowiono zatrudnić dodatkową osobę - chłopca imieniem Morino Ryoushi, który właśnie wyznał Ryouko swoją miłość.