Na początek: Avengers to jedna z najlepszych ekranizacji komiksu w historii kina. Dziękuję, teraz do rzeczy.

[SPOILERY do filmu i komiksów]
Podobieństwa między filmowym uniwersum Marvela, a Universum Ultimate z komiksów są oczywiste (jak choćby czarny Nick Fury), ale wydaje mi się, że Wheadon wyjątkowo mocno inspirował się komiksami Ultimates:
-Wygląd siedziby Shield bardzo przypomina wyspę Triskelion z komiksu
-Starcie Thora z Capem i Ironmanem bardzo podobne do tego z Ultimates (tylko, że tam byli jeszcze hipisi dookoła).
-Prawie identyczny sposób pozbycia się bomby atomowej (w komiksie portal jest otwarty przez Thora)
-Motyw mszczącego się Hawkeye'a
-Loki wpuszczający armię potworów/obcych do Nowego Jorku

Swoją drogą, jeśli ktoś jest zainteresowany komiksowym pierwowzorem Avengers, to polecam zacząć właśnie od Ultimates i Ultimates 2.