Teru Aoki wraca do domu pociągiem. Niestety, podczas przejazdu tunelem dochodzi do katastrofy, z której cało wychodzą jedynie Teru i Ako Seto. Razem wychodzą z tunelu i odkrywają, że świat został zniszczony w wyniku tajemniczej katastrofy. Wspólnie wyruszają w podróż przez zniszczony kraj do Tokio, gdzie mają nadzieję dowiedzieć się, co się stało.

Dragon Head to opowieść o studencie Teru Aoki. W drodze do domu z wycieczki szkolnej wraz ze swoimi nauczycielami i przyjaciółmi ze szkoły w środku tunelu wykoleja się pociąg, w którym jadą. Tylko garstce ludzi udaje się przeżyć. Po straszliwym starciu z atakującymi ich siłami w tunelu, grupie udaje się uciec. Lecz terror po wyjściu z tunelu jest jeszcze większy. Tokyo ktore znali zniknęło, a oni zmuszeni są walczyć o przeżycie w tym przedziwnym otoczeniu.