Podążając za wskazówkami, które zostawił mu ukochany dziadek, Jake odkrywa, że istnieje niezwykły świat poza czasem i przestrzenią, a w nim niezwykłe miejsce, zwane "Osobliwym domem pani Peregrine". Jake poznaje niesamowite moce mieszkańców domu i dowiaduje się, że mają oni potężnych wrogów. Wkrótce przekona się, że jeśli chce ocalić swych nowych przyjaciół, musi nauczyć się korzystać z "osobliwości", którą sam został obdarzony.

Wywołująca dreszcz emocji i grozy opowieść o domu sierot na tajemniczej wyspie, zamieszkiwanej niegdyś przez równie tajemnicze dzieci. Szesnastoletni Jakub, którego dziadek był jednym z nich, przyjeżdża na wyspę, żeby za wszelką cenę odkryć przeszłość dziwnego, zniszczonego domu i jego małych mieszkańców.

Kiedy Jake odkrywa zagadkę, która pozwala połączyć alternatywne rzeczywistości i czasy, odkrywa on sekretne schronisko znane jako Osobliwy dom Pani Peregrine. Jake poznaje rezydentów tego miejsca oraz ich niespotykane zdolności, lecz odkrywa, że bezpieczeństwo to iluzja, a zło czyha w ukryciu. Mężczyzna musi odróżnić prawdę od nieprawdy i poznać komu może zaufać i kim tak naprawdę jest.