Akcja filmu rozgrywa się na przedmieściu Black Falls, gdzie wszystkie domy wyglądają tak samo, a wszyscy dorośli pracują w fabryce Black Box Unlimited Worldwide Industries Incorporated. Tam właśnie powstaje Czarna Skrzynka pana Blacka, uniwersalne urządzenie do wszystkiego. Jednak jedyną rzeczą jaką Pan Black uczynił dla 11-letniego Toe Thompsona, to zapewnienie pracy jego rodzicom. Tymczasem Toe chciałby poznać nowych przyjaciół. Wszystko zmienia się, kiedy z nieba spada tęczowy kamień, uderza go w głowę i zmienia wszystko. Kamień okazuje się lepszą wersją Czarnej Skrzynki, gdyż spełnia życzenia. Już wkrótce okolica zaroi się od miniaturowych statków kosmicznych, armii krokodyli i innych magicznych stworzeń. Jednak prawdziwy chaos zacznie się z chwilą, w której tęczowy kamień wpadnie w ręce dorosłych. Teraz Toe i jego przyjaciele będą musieli zjednoczyć się w walce o ocalenie miasta. Po drodze zrozumieją, że to, czego sobie życzą nie zawsze jest tym, czego naprawdę potrzebują.

Kiedy agenci Ingrid i Gregorio Cortez zostają porwani, z pomocą wyruszają ich dzieci.

W małym miasteczku pojawia się El Mariachi, były muzyk z futerałem pełnym broni. Poszukuje zabójcy swojej ukochanej, by pomścić jej śmierć.