Zmarł w Pradze (Austro-Węgry, obecnie Czechy). Jego grób znajduje się na Cmentarzu Wyszehradzkim w Pradze (Czechy).
W 1883 jego choroba psychiczna na tyle się nasiliła, że został umieszczony w szpitalu w Pradze, gdzie zmarł w następnym roku.
Pochodził z rodziny wielodzietnej. Jego rodzice Barbora Lynkova i Franciszek Smetana mieli dziesięcioro dzieci. Bedrzich był ich trzecim dzieckiem i pierwszym synem. Miał ponadto pięć sióstr z poprzednich małżeństw ojca.