Natalie (Diane Keaton) to opiekuńcza matka, która zawsze pielęgnowała niezwykle bliskie relacje ze swoją córką Sarą (Alexa Davalos). Kiedy jednak Sara ginie w wypadku samochodowym Natalie przeżywa ogromny wstrząs dowiadując się, że jej córka nie była osobą, którą ona znała. Zdecydowana za wszelką cenę poznać prawdziwe oblicze ukochanego dziecka wyrusza w podróż, której celem jest stary dom na plaży, w którym Sara spędzała swoje wakacje. Wierzy, że najlepsi przyjaciele córki pomogą jej odkryć prawdę.
Fabularnie "Dzieci Diuny" łączy w sobie wątki z drugiego i trzeciego tomu cyklu: "Mesjasza Diuny" i "Dzieci Diuny". Tematem filmu jest walka Paula Atrydy z zakonem Bene Gesserit, który nie potrafi kontrolować Muad'Diba, a także wydarzenia, które miały miejsce po odejściu Paula na pustynię, kiedy rozpoczęła się Ekologiczna Transformacja Diuny, a na Arrakis pojawił się tajemniczy starzec zwany Kaznodzieją.
Margaret (Tilda Swinton) ma syna Beau (Jonathan Tucker), który jest homoseksualistą. Pewnego dnia znajduje na plaży zwłoki jego partnera. Zdesperowana matka chce chronić syna i wrzuca ciało do jeziora. Wkrótce jest szantażowana przez Aleka (Goran Višnjić), który zna pewien sekret pary "kochanków" uwieńczony na VHS, do tego policja znajduje ciało w rzece . Czy Margaret uda się uchronić siebie i syna z narastajacych coraz bardziej problemów.
Film przedstawia dzień z życia sklepu muzycznego "Empire Records". Jego pracownicy to siódemka ekscentrycznych, młodych ludzi - prawdziwych pasjonatów muzyki. Każde z nich przeżywa właśnie życiowy kryzys. Również właściciel zmaga się z krytyczną dla wszystkich decyzją, dotyczącą przyszłości tego kultowego dla melomanów miejsca. Z uwagi na problemy finansowe obiektowi grozi bowiem wykupienie przez dużą sieć. Dodatkowych wrażeń dostarczają odwiedziny Rexa Manninga - przejrzałej gwiazdy muzyki pop, która ma promować w sklepie swój najnowszy album.
Osierocony P.K. znajduje przystań pod opieką profesora von Vollensteena i czarnoskórego więźnia Geela. Obaj mężczyźni starają się wszechstronnie wyedukować chłopca.