Na drodze głównych bohaterów pojawia się nowy wróg, którego celem jest zniszczenie świata astralnego i ocalenie tym samym własnego.

Film animowany "Turtles Forever" krzyżuje losy nowoczesnych, tajemniczych i poważnych żółwi ninja z ich radosnymi, zabawnymi oraz lekko beztroskimi odpowiednikami wykreowanymi w latach osiemdziesiątych. Zetknięcie się równoległych wymiarów doprowadza także do spotykania się dwóch wersji Shreddera, który, współpracując z samym sobą, zamierza pozbyć się swoich wrogów w każdej istniejącej rzeczywistości poprzez zniszczenie archetypowych odpowiedników wojowniczych żółwi.

Ash i przyjaciele przybywają do zamku Camaron, gdzie odbywa sie turniej ku czci Strażnika Aury. Ash wygrywając turniej otrzymuje na jeden wieczór historyczne berło które posiadał wiele wieków wcześniej bohater Aaron. Kiedy Ketchum dostaje w dłonie berło budzi Lucario, Pikachu nagle znika. Ash rozpoczyna podróż do mistycznego drzewa, wraz z Lucario który obiecał pomóc w odnalezieniu Pikachu. Tym samym rozpoczyna się seria niefortunnych zdarzeń, która może ponownie postawić losy ziemi na krawędzi!