Men in Black zawsze chronili Ziemię przed szumowinami z innych planet. Tym razem zmierzą się z największym globalnym zagrożeniem w historii – w ich organizacji jest... wtyczka.

Wspaniały Gonzo czuje się samotny. Jednakże pewnego dnia, podczas śniadania, przez płatki owsiane kontaktują się z nim kosmici. Gonzo jest przekonany o swych pozaziemskich korzeniach i pozaziemskiej rodzinie. Jego przyjaciele obawaiają się, że Gonzo trochę zwariował. Jednakże pewnego dnia zostaje on porwany przez złego agenta. Kermit i reszta Muppetów musi uwolnić swego przyjaciela ...