Momonga, uwięziony w grze jako Król Czarnoksiężników Ains Ooal Gown, jednoczy siły ze Świętym Królestwem i Teokracją Slane, by pokonać demonicznego cesarza Jaldabaotha i jego armię półludzi, zagrażających pokojowi w regionie.
Były poszukiwacz przygód Belgrieve znajduje w lesie porzuconą dziewczynkę, którą postanawia wychować. Angeline wyrasta na poszukiwaczkę przygód rangi S i chcąc zdobyć sławę wyrusza w świat.
Japońskie miasto ogarnia seria brutalnych zabójstw, których ofiary pozbawiane są głów. W tym samym czasie uczeń liceum zaczyna mieć koszmary o ścięciu na gilotynie.
Ash dołącza do Volcaniona, mitycznego pokemona, który udaje się do zmechanizowanego miasta, aby uratować Magearnę — pokemona będącego dziełem ludzkich rąk.
Ash, Pikachu i ich przyjaciele podczas odwiedzin w pustynnym mieście spotykają na swojej drodze Hoopę, Pokémona który dzięki swoim pierścienią może przywoływać zarówno ludzi jak i swoich pobratymców. Stwarza to ogromne zagrożenie dla równowagi świata. Ash musi odnaleźć bohatera, który dawno temu powstrzymał przerażające monstrum.
Ash po powrocie z regionu Unova, gdzie poznał dziennikarkę Alexę, postanawia udać się do jej rodzinnego regionu Kalos. W nowych przygodach bohaterowi towarzyszy Serena oraz rodzeństwo Clemont i Bonnie.
17-to letni Yoshiharu Sagara, uczeń liceum przenosi się w czasie i zauważa, że znalazł się w centrum bitwy z okresu Sengoku. Przed śmiercią ratuje go słynny Hideyoshi Toyotomi, lecz w rezultacie mężczyzna sam ginie od zabłąkanej kuli. W obawie przed wypaczeniem historii, Yoshiharu zajmuje jego miejsce i zostaje jednym z doradców Nobuny Ody.