Pracownik sektora ochrony zostaje zwerbowany przez swoją byłą żonę do pomocy w oddziale policji, zajmującym się zaginięciami. Wspólnie starają się wyjaśnić zagadkę związaną z ich synem, który po sześciu latach od zniknięcia nagle się odnajduje.

Agentka FBI Olivia Dunham wraz z genialnym naukowcem Walterem Bishopem i jego synem Peterem tworzą zespół prowadzący śledztwa dotyczące serii zagadkowych zdarzeń.