Kenshin trenuje ze swoim mistrzem i uczy się technik niezbędnych, aby powstrzymać Shishio przed obaleniem rządu i pogrążeniem Japonii w chaosie.

Rin (Yumi Sugimoto) jest młodą atrakcyjną kobietą, prześladowaną przez rówieśników, która odkrywa, że jej ramie zaczyna mutować w śmiercionośną broń. Dziewczyna natychmiast staje się celem tajnej rządowej organizacji. Rodzice Rin zostają zamordowani przez oddział komandosów na jej oczach. Przepełniona żądzą zemsty dziewczyna wykorzystuje swe zmutowane ramię by rozprawić się z niebezpiecznymi żołnierzami.

Nastoletnia Ami, wyposażona w karabin maszynowy zamiast ręki, postanawia zemścić się na yakuzie za śmierć brata.