Brandon Beckett wraz z nowo utworzoną jednostką o nazwie G.R.I.T. wyrusza na tajną misję na Maltę, aby zlikwidować międzynarodową grupę terrorystyczną i odbić od nich swoją tajną agentkę.
Hypatia próbuje uratować od zapomnienia dorobek greckiej nauki i filozofii. Tymczasem w Aleksandrii dochodzi do sporów między poganami a chrześcijanami.