Kiedy niewielki samolot rozbija się na kanadyjskim pustkowiu, jedyna ocalała z katastrofy osoba musi podjąć walkę z żywiołami i własnymi demonami, aby przeżyć.
Minęło prawie 30 lat, odkąd dr Sam Beckett wszedł do akceleratora kwantowego skoku i zniknął na dobre. Teraz nowy zespół naukowców pod wodzą fizyka Bena Songa zamierza wrócić do badania niezwykłej maszyny, aby poznać tajemnice jej oraz jej twórcy. Wszystko jednak się zmienia, kiedy doktor Song niespodziewanie przenosi się do przeszłości i także zostaje zagubiony w czasie.
Gwiezdne Wrota: Atlantyda to najnowszy serial bazujący na tematyce z serialu Gwiezdne Wrota SG-1. Opowiada przygody całkiem nowych bohaterów w świecie Gwiezdnych Wrót. Akcja toczy się już po przygodach grupy SG-1 w odległej galaktyce. Jedynie w epizodach będziemy mogli zobaczyć członków słynnej już grupy SG-1.