Eksperyment naukowy doprowadził do stworzenia klona Mewtwo, który postanawia zniszczyć świat. Ash i przyjaciele postanawiają pokrzyżować jego plany.

Ash rusza z pomocą uwięzionej matce i córce profesora Hale. Na jego drodze staje Unown, tajemniczy pokemon posiadający moc zamiany myśli w rzeczywistość.

Ash wyrusza w podróż, by zostać najlepszym trenerem pokemonów na świecie.

Dwudziestosiedmioletnia tokijska urzędniczka wyjeżdża spędzić kilkudniowy urlop na wsi. Tam powracają wspomnienia z dzieciństwa.