Ash, Pikachu oraz ich przyjaciele Misty i Brock podróżują i pomagają potrzebującym Pokémonom, a z góry cały czas ktoś ich obserwuje.

Eksperyment naukowy doprowadził do stworzenia klona Mewtwo, który postanawia zniszczyć świat. Ash i przyjaciele postanawiają pokrzyżować jego plany.

Monotonne życie czternastolatki zmienia się, kiedy dokonuje ona odkrycia w lokalnej bibliotece.