Sam Flynn zostaje wciągnięty do wirtualnego świata, stworzonego przed laty przez swojego zaginionego ojca. Odtąd musi walczyć o przetrwanie w cyfrowej rzeczywistości.
Rok 1985, ginie jeden z byłych superbohaterów. Jego przyjaciel stara się odnaleźć mordercę, pomimo że działalność zamaskowanych mścicieli została zakazana.
Trzecia część ekranizacji komiksów o tytułowych mutantach. Bohaterowie stają przed wyborem – pozostać sobą czy skorzystać z wynalezionego właśnie lekarstwa cofającego mutację.