W roku 2029 świat jest połączony gęstą elektroniczną siecią, która rządzi każdym aspektem ludzkiego życia. Ta sama sieć staje się polem bitwy dla Sekcji Dziewiątej tokijskich sił bezpieczeństwa, która ma doprowadzić do aresztowania mistrza hakerów znanego jedynie jako Władca Marionetek.

Kontynuacja 'Magic Knight Rayearth'. Hikaru, Umi i Fuu powróciły do Tokio. Lecz ich zachowanie się zmieniło. Są przygnębione i dręczą ich wyrzuty sumienia. Chcąc powrócić do Cephiro spotykają się w Tokyo Tower. Nagle pojawai się błysk światła i znów są w Krainie Marzeń. Ale to nie jest ta sama kraina, co kiedyś. Miejsce roślinności zajął piasek i nagie góry, a na środku tego pustkowia stoi zamek z kryształu. Po spotkaniu z Clefem dowiadują się, iż Cephiro atakuja trzy kraje: Autozam, Faren i Chizeta...

Lupin III ze swoim partnerem Jigenem rabują Zamek Cagliostro, w środku którego odnajdują uwięzioną księżniczkę.