Po II wojnie Sojuszu z PLANT pilot Gundam Kira Yamato zasila szeregi organizacji, która ma na celu wyeliminować pozostałych członków Niebieskiego Kosmosu.
W 2024 roku ruiny Japonii zamieszkują surrealistyczne potwory, a ocalali ludzie walczą o przetrwanie. Kiruko postanawia spełnić ostatnie życzenie tajemniczej umierającej kobiety, by zabrać jej syna Maru do miejsca zwanego Niebem.
Smok Letty po wyrzuceniu przez rodziców wyrusza w świat aby znaleźć nowy dom. Jednakże jako legendarna bestia jest pożądany przez wszystkich, co nie ułatwi mu i tak już trudnego zadania.
Potomek Jonathana Joeastara, zwący się Jotaro Kujo, wyrusza do Egiptu, by uratować życie swojej matki, jak i pokonać tego, który czyha na krew jego rodziny.
17-to letni Yoshiharu Sagara, uczeń liceum przenosi się w czasie i zauważa, że znalazł się w centrum bitwy z okresu Sengoku. Przed śmiercią ratuje go słynny Hideyoshi Toyotomi, lecz w rezultacie mężczyzna sam ginie od zabłąkanej kuli. W obawie przed wypaczeniem historii, Yoshiharu zajmuje jego miejsce i zostaje jednym z doradców Nobuny Ody.
W pewnej wiosce w Japonii, w tajemnicy przed resztą świata ludzie współżyją z tajemniczymi istotami zwanymi kakashi. Kyouhei Kuga wyjechał z tego miejsca, by zapomnieć o tragicznych wydarzeniach z przeszłości. Udało mu się uwolnić od archaicznych praw wioski i właśnie zaczął układać sobie życie. Teraz studiuje na jednej z tokijskich uczelni i po kryjomu podkochuje się w pięknej Hibino. Pewnego razu po całonocnej imprezie Kyouhei wraz z ową dziewczyną natrafiają na zmasakrowane zwłoki w windzie. Szybko okazuje się, że z Karakami, rodzinnej wioski Kyouheia uciekł jego brat Aki. Na domiar złego Aki posiada zdolność do kontrolowania za pomocą umysłu jednego z kakashi. Teraz uwolniony ze swojej celi pragnie dokonać zemsty na mieszkańcach wioski.