Duńska agentka tajnych służb Katrine Poulson, oraz brytyjska szpieg Beatrice Ogilvy, wspólnie uczestniczą w desperackim wyścigu z czasem. Obie zostają wplątane w sieć kłamstw, morderstw i walki o władzę.

Hunt i jego ekipa zostają oskarżeni o zamach w siedzibie rosyjskiej Dumy. Planują udaremnić kolejny atak i oczyścić się z zarzutów.

Fabularnie "Dzieci Diuny" łączy w sobie wątki z drugiego i trzeciego tomu cyklu: "Mesjasza Diuny" i "Dzieci Diuny". Tematem filmu jest walka Paula Atrydy z zakonem Bene Gesserit, który nie potrafi kontrolować Muad'Diba, a także wydarzenia, które miały miejsce po odejściu Paula na pustynię, kiedy rozpoczęła się Ekologiczna Transformacja Diuny, a na Arrakis pojawił się tajemniczy starzec zwany Kaznodzieją.