Skazany za morderstwo Richard Matt (Benicio Del Toro) opracowuje plan ucieczki. W realizacji zamiarów pomaga mu Tilly Mitchell (Patricia Arquette) – pracująca żona i matka, która kieruje więzienną szwalnią. Tilly wdaje się w romans z Mattem, ale także drugim skazanym – Davidem Sweatem (Paul Dano). Ten odsiaduje wyrok za zabicie policjanta i być może darzy Tilly prawdziwym uczuciem. David dość niechętnie zgadza się pomóc Richardowi Mattowi w realizacji jego planu.
Wskutek zbyt długiego przebywania w więziennej izolatce Henry staje się szaleńcem i mordercą. Jego prawnik próbuje udowodnić, że częściową winę za tę sytuację ponosi Alcatraz.
Łowca nagród Tommy Nowak otrzymuje zadanie wytropienia Lou Ann, która w terminie nie zapłaciła kaucji. Kobietę poruszającą się różowym cadillakiem próbuje także schwytać grupa neonazistów.