Historia braci Bondurant, którzy utrzymują się z produkcji bimbru podczas prohibicji w USA. Kiedy odmawiają płacenia łapówek chciwemu prokuratorowi, w ich rodzinnym hrabstwie wybucha krwawy konflikt.
Dwaj bracia, Carmelo i Gino, są wychowywani przez szefa mafii Salvatora Gianniego. Kiedy ten ginie w niejasnych okolicznościach, chłopcy postanawiają odnaleźć morderców.
Fabularnie "Dzieci Diuny" łączy w sobie wątki z drugiego i trzeciego tomu cyklu: "Mesjasza Diuny" i "Dzieci Diuny". Tematem filmu jest walka Paula Atrydy z zakonem Bene Gesserit, który nie potrafi kontrolować Muad'Diba, a także wydarzenia, które miały miejsce po odejściu Paula na pustynię, kiedy rozpoczęła się Ekologiczna Transformacja Diuny, a na Arrakis pojawił się tajemniczy starzec zwany Kaznodzieją.