W serialu po raz pierwszy pojawia się Kano w czerwonym przebraniu. Zmienia się również jego narodowość. Nie jest Amerykaninem lecz Australijczykiem (na cześć Trevora Goddarda, zmarłego w 2003 roku aktora, który odtwarzał rolę Kano w pierwszym filmie).
W serialu nie pojawiły się następujące postaci: Kung Lao, Johnny Cage, Mileena, Jade, Sindel, Noob Saibot, Baraka, Jarek, Reiko, Tanya, Shinnok, Goro i Kintaro.
Mimo, że Baraka nie pojawia się w serialu, w jednym z odcinków możemy zauważyć grupę wojowników rasy Tarkatan. Dowodzi nimi niejaki Karbrac, co fonetycznie odpowiada "Barace".
Mimo, że w serialu pojawia się wielu zielonych wojowników ninja, to jednak żaden z nich nie został nazwany Reptile (tak jak jest to w kanonie serii). Jednego z nich nazwano jednak Komodai.
To tutaj po raz pierwszy pojawia się postać Quan Chi, która później znajdzie się w następujących grach: Mortal Kombat Mythologies - Sub-Zero, Mortal Kombat Conquest, Mortal Kombat 4, Mortal Kombat Deadly Alliance, Mortal Kombat Deception i Mortal Kombat Armageddon.
W odcinku "Acid Tongue", Jax ściąga swój pancerz z rąk, co wśród fanów wywołało kontrowersje, gdyż według kanonu całej serii, implanty były przytwierdzone na stałe.
Cyrax, Sektor, Smoke, Rain, Kabal i Ermac w poszczególnych epizodach występują bez masek, jednak poza Kabalem ich historie nie należą do kanonu "Mortal Kombat" (zostały wymyślone na potrzeby serialu).