Akcja gry dzieje się 10 lat po zakończeniu "Dragon Age: Początek". Trwa spór pomiędzy magami a templariuszami. Królestwo Ferelden nie zostało w pełni odbudowane po inwazji Mrocznych Pomiotów, natomiast w krainie Orlais toczy się wojna domowa. Niespokojna sytuacja na kontynencie powoduje inwazję demonów, które sieją zamęt i zniszczenie. Do walki z wrogimi istotami zostaje powołana niezależna inkwizycja. Na jej czele staje gracz, który musi odnaleźć osobę winną powstałego nieszczęścia i zapobiec dalszej ofensywie demonów.