Od wydarzeń przedstawionych w pierwszej części gry minęło 6 lat. Ludzkość pogrążona jest w krwawej wojnie domowej. Rząd Orbitali walczy z samozwańczym Sojuszem Ludzi i Obcych. Kal Wardin odszedł ze służby w N.O.V.A. wiele lat temu i mieszka teraz na pustynnej planecie Scorpius. Ale wojna dociera w nawet w najbardziej odległe zakątki wszechświata... Niepowtarzalny świat oraz zróżnicowana rozgrywka w trybie dla jednej i wielu osób – oto nowy wymiar gier FPS z gatunku science fiction.