"Ghost Recon: Island Thunder" to drugie oficjalne rozszerzenie do pierwszej części gier z serii "Ghost Recon". Jest rok 2009, dowodzony przez gracza oddział rusza na Kubę. Po śmierci dyktatora Fidela Castro w kraju zapanował chaos. Do władzy próbują dojść różni rebelianci i samozwańczy przywódcy. Drużyna "Duchów" zostaje włączona w skład sił misji ONZ, której zadaniem jest przywrócenie porządku w kraju oraz doprowadzenie do pierwszych wolnych wyborów. Producenci przygotowali osiem misji w trybie dla pojedynczego gracza oraz pięć nowych map i dwa nowe warianty rozgrywki w trybie multiplayer. Poszerzono również dostępny arsenał broni i pojazdów opancerzonych.