W 2004 istnieje duże prawdopodobieństwo, że Gruzja może posiadać dostęp do broni masowego rażenia. Ponadto, niewykluczone są powiązania prezydenta z mafią. W tym celu, agencja NSA wysyła kolejnych agentów do zbadania sprawy, lecz giną oni w niewyjaśnionych okolicznościach. Dlatego też do akcji wkraczasz Ty, Sam Fisher – najlepiej wyszkolony agent do tajnych operacji na świecie. Pamiętaj, że Twoje działania nie mogą trafić do wiadomości publicznej, także musisz działać po cichu, za plecami wrogów. Tylko to gwarantuje zażegnanie kryzysowej sytuacji.