Film opowiada historię grupy młodych ludzi, którzy właśnie kończą szkołę średnią. Skromna Kayoko (Nana Eikura) planuje dalszą naukę na Uniwersytecie Tokijskim i ma konkretne plany życiowe. Jednak jej uczucia nie są już tak sprecyzowane - wydaje się być zakochana ze wzajemnością w przebojowym Tomizo (Tasuku Emoto), ale nie jest jej obojętny również cichy Takumi (Hoshi Ishida), najlepszy przyjaciel Tomizo i jego kolega z drużyny bejsbolowej. Cała trójka zna się od szkoły podstawowej, tym trudniej jest im więc oddzielić przyjaźń od miłości. Z kolei początkująca w świecie muzyki Megumi (Mitsuki Tanimura) znajduje pokrewną duszę w wokaliście Kazuyi (Naojirô Hayashi)...

Lemon no Koro, będący adaptacja powieści Miho Toshimy, pozwala przenieść się z powrotem w szkolne lata i na nowo powspominać ówczesne miłostki, przyjaźnie, pierwsze miłości, tajemnice i obawy. Gdyby opisywać szkołę średnią za pomocą zmysłu smaku, byłby to właśnie smak cytryny - cierpki i pozostający na długo w pamięci...