Podczas przelotu nad obszarem Trójkąta Bermudzkiego, Air Force One ulega awarii wskutek uderzenia przez błyskawicę. Nim maszyna eksploduje, załodze udaje się umieścić prezydenta DeSteno (John Savage) w kapsule ratunkowej, która zostaje wystrzelona do oceanu. Marynarka USA rozpoczyna poszukiwania przywódcy. Akcją ratunkową dowodzi admirał Linda Hansen (Linda Hamilton). Niespodziewanie flotę atakuje stado nieznanych nauce istot przypominających długie macki, które wyłaniają się z wody. Trip Oliver (Trevor Donovan), świadom upływu czasu zmniejszającego szanse prezydenta na przeżycie, postanawia zaryzykować i bez zezwolenia zwierzchników wykorzystać eksperymentalną łódź podwodną Prometeusz. Podczas gdy załogi okrętów usiłują odeprzeć atak agresywnych macek, oddział Olivera przeczesuje głębiny w poszukiwaniu kapsuły. Po dotarciu do podwodnej jaskini żołnierze ze zdumieniem odkrywają, że mają do czynienia z obcą cywilizacją...