Kontynuacja wydarzeń z pierwszego sezonu Made in Abyss. Do podróżujących na dno Otchłani Riko i Rega dołącza Nanachi. Po przebyciu znajdującego się na piątej warstwie Oceanu Zwłok trafiają do placówki badawczej, gdzie swą siedzibę ma Bondrewd zwany Suwerenem Brzasku.
Shōyō Hinata zaprzysięga zemstę na Tobio Kageyamie, który upokarza go podczas międzyszkolnego turnieju. Przekorny los sprawia jednak, że obaj zawodnicy ponownie się spotykają, tym razem po tej samej stronie siatki.