Grupa pracowników rządowej agencji NCIS rozwiązuje trudne zagadki kryminalne związane z Marynarką Wojenną. Dowodzi nią działający według własnych zasad Jethro Gibbs.
Sydney Bristow jest podwójną agentką, która dzieli życie pomiędzy rozpracowywaniem tajnej organizacji terrorystycznej oraz zdobywaniem informacji dla CIA a byciem zwykłą studentką.