Po II wojnie Sojuszu z PLANT pilot Gundam Kira Yamato zasila szeregi organizacji, która ma na celu wyeliminować pozostałych członków Niebieskiego Kosmosu.

To opowieść z czasów, zanim „Błyskawica” oraz „Czarny Szermierz” byli znani pod swoimi pseudonimami… Asuna była jeszcze uczennicą trzeciej klasy szkoły średniej, gdy po raz pierwszy założyła NerveGeara, nie mając przy tym żadnego doświadczenia z grami online. 6 listopada 2022 roku to data premiery pierwszej na świecie gry VRMMORPG nowej generacji, Sword Art Online. Podekscytowani pierwszym zalogowaniem gracze zostają uwięzieni w wirtualnym świecie przez Mistrza Gry, który pozbawił ich jakiejkolwiek możliwości opuszczenia rozgrywki do czasu jej ukończenia. Mistrz Gry dał graczom ostrzeżenie: „Nie możecie wylogować się z własnej woli, jeśli ktoś z was umrze w grze, umrze również w rzeczywistości”. Po tych słowach wybuchła panika i zapanowało pandemonium. Asuna, nie znając zasad gry, wyrusza na podbój pierwszego piętra latającego zamku Aincrad. W świecie, w którym śmierć czyha na każdym rogu, Asunie przeznaczone jest wyjątkowe spotkanie. Oraz bolesne pożegnanie... Zdana na łaskę nowej rzeczywistości, Asuna walczy z całych sił o przetrwanie, aż w pewnym momencie na swojej drodze spotyka pewnego zdystansowanego szermierza o imieniu Kirito...

Pewnego dnia Yomogi Asanaka, uczeń pierwszego roku liceum Fujiyokidai, poznaje tajemniczego mężczyznę o imieniu Gauma, który twierdzi, że jest "użytkownikiem kaiju". Po nagłym pojawieniu się potworów, do akcji wkracza także gigantyczny robot DYNAZENON. Yomogii i jego przyjaciele, którzy znaleźli się w niewłaściwym miejscu o niewłaściwym czasie, zostają wciągnięci w walkę z kaiju.

Kaguya i Miyuki - wzorowi uczniowie liceum Shuchiin się w sobie podkochują, lecz żadne z nich nie ma odwagi wyznać swoich prawdziwych uczuć.