Komandos John Clark chce pomścić śmierć żony, tym samym wplątuje się w większy spisek.

W pozbawionym okien pomieszczeniu, gdzieś we wschodniej Afryce, islamscy bojownicy przetrzymują Anglika Jamesa More’a. W tym samym czasie, na drugim końcu świata, na skutej lodem Grenlandii Danielle Flinders przygotowuje się do eksploracji dna oceanu. Myśli obojga wciąż wracają do pewnego zimowego dnia sprzed roku, kiedy przypadkowe spotkanie na francuskiej plaży przerodziło się w namiętny romans i na zawsze naznaczyło losy obojga…

Belle zgadza się zamieszkać ze straszliwym potworem, aby ratować ojca. W pałacu dziewczynę nękają dziwne i tajemnicze sny, które pomagają jej poznać prawdziwe oblicze bestii.

Doktor Martin Harris budzi się po wypadku samochodowym w Berlinie i odkrywa, że żona go nie rozpoznaje, a jego tożsamość przyjął inny mężczyzna.

Film rozgrywa się w odległej przyszłości, kiedy to tajemnicza choroba uśmierciła większą część ludności. Aeon Flux ma zabić jednego z głównych członków Kongresu rządzącego Bregną.