Przepełnione tajemniczą mocą karty z innego świata spadły na ziemię. Jak krople uciążliwego deszczu zalały kontynenty. Dzieciaki wpadły w euforię, ale część szybko uznała, że te karty są beznadziejne. Została jednak grupa, której udało się odkryć magiczne właściwości. Powstała gra wojenna. W pojedynku, po wyrzuceniu karty, na polu bitwy pojawia się kula. A z niej… wyłania się potężna istota, której wizerunek widnieje na karcie. Te istoty to Bakugany. Każdy z nich ma swój żywioł: Pyrus – ogień, Haos – światło, Ventus – wiatr, Aquos – woda, Darkus – ciemność, oraz Subterra – ziemia.Trzeba bardzo uważać, aby wyrzucić odpowiednią kartę. Raz pokonany Bakugan przepada na zawsze – dostaje się do Wymiaru Zagłady, z którego nie ma już wyjścia. Dzieci nie zdawały sobie sprawy, że ich gra odzwierciedla równoległy świat – Vestroię, w której każda walka odbywa się naprawdę. A spokój utrzymywany dzięki Jądru Ciszy i Jądru Nieskończoności został właśnie zachwiany. Pojawił się Bakugan, którego celem było zdobycie władzy. Vestroia zaczyna się rozpadać. Także świat ludzi staje się zagrożony. Przyjaciele Shuna – Dan, Runo, Marucho, Julie, Alice i Joe - zwani Młodymi Wojownikami muszą przywrócić porządek.

Echizen Ryoma choć wygrał cztery z rzędu mistrzostwa dla juniorów w USA i jest powszechnie uznawany za geniusza to tak naprawdę żyje on ciągle w cieniu swojego ojca – legendarnego tenisisty znanego jako Samuraj Nanjirou. Mając 12 lat wraca on z rodzicami do Japonii i zapisuje się do gimnazjum Seishun Gakuen (w skrócie Seigaku) – tego samego, do którego przed laty uczęszczał jego ojciec. Ryoma dołącza do tamtejszego klubu tenisa, który jest powszechnie znany jako jeden z najlepszych w całym kraju. Bez problemu udaje mu się pokonać starszych kolegów czym zwraca na siebie uwagę kapitana, który robi dla niego wyjątek i daje mu szansę, aby dołączył do podstawowego składu. Chłopiec poznaje i zaprzyjaźnia się ze starszymi, równie utalentowanymi co on kolegami. Łączy ich ten sam cel: wszyscy oni chcą, aby ich drużyna zdobyła mistrzostwo Japonii.