Bohaterskie, zakochane w pizzy wojownicze Żółwie Ninja: Leo, Mikey, Raph i Donnie, muszą odnaleźć w sobie siłę i odnowić stare sojusze, aby stawić czoła zarówno trudnościom okresu pokwitania, jak i nowemu złu, które czai się w zaułkach Nowego Jorku.

Dziesięcioletni Ben Tennyson odkrywa tajemniczy kosmiczny zegarek - Omnitrix - dzięki któremu zyskuje moc przemieniania się w dziesięciu niesamowitych kosmitów.